119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2188 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2188  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0161821  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3479  putative copper/zinc superoxide dismutase  81.36 
 
 		 177 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1018  superoxide dismutase copper/zinc binding  80.79 
 
 		 177 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0356333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0859  superoxide dismutase, Cu-Zn  65.24 
 
 		 216 aa  256  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1214  superoxide dismutase, Cu-Zn  69.61 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1056  copper/zinc superoxide dismutase  69.61 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1062  copper/zinc superoxide dismutase  69.61 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0713  superoxide dismutase, Cu-Zn  69.06 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2300  superoxide dismutase, Cu-Zn  69.06 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2986  superoxide dismutase, Cu-Zn  69.06 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1613  superoxide dismutase, Cu-Zn  69.06 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2481  superoxide dismutase, copper/zinc binding  76.16 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2347  superoxide dismutase copper/zinc binding  76.16 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5765  copper/Zinc superoxide dismutase  75.5 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212202  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1823  superoxide dismutase, copper/zinc binding  76.16 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2434  superoxide dismutase, copper/zinc binding  76.16 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0860  superoxide dismutase copper/zinc binding  75.5 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0340028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2439  superoxide dismutase copper/zinc binding  76.16 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  36 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.44 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  35.29 
 
 		 171 aa  95.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  38.89 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.37 
 
 		 177 aa  91.3  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.27 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.27 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.76 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.02 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  36.17 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  35.21 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.56 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.11 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.25 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  34.27 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.06 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  29.49 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.33 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  30.34 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  36.73 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.65 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.59 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.99 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  33.79 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.68 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  33.33 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  26.79 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  27.54 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.9 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  26.19 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.38 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.38 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.38 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.38 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.38 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  26.19 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  32.45 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.09 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  25.6 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.63 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  32.14 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  35.04 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  32.84 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.84 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.57 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.14 
 
 		 171 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.88 
 
 		 171 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.08 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  30 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.83 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.12 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.84 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.3 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.08 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  29.08 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.08 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  26.58 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.06 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.83 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.83 
 
 		 162 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  28.03 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.45 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  28.57 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  20.81 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.07 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  31.72 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  30.46 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  30.46 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  30.46 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  30.07 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  29.37 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  29.37 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  29.37 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  29.37 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  29.37 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  29.37 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  29.79 
 
 		 180 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  29.37 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  27.59 
 
 		 178 aa  45.1  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  29.37 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.815221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>