118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2439 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1823  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
178 aa  349  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2434  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
178 aa  349  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2439  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
178 aa  349  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305746  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5765  copper/Zinc superoxide dismutase  94.94 
 
 
178 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212202  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0860  superoxide dismutase copper/zinc binding  93.26 
 
 
178 aa  294  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0340028  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2481  superoxide dismutase, copper/zinc binding  95.51 
 
 
178 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2347  superoxide dismutase copper/zinc binding  95.51 
 
 
178 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1214  superoxide dismutase, Cu-Zn  80.34 
 
 
179 aa  283  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1056  copper/zinc superoxide dismutase  80.34 
 
 
179 aa  283  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1062  copper/zinc superoxide dismutase  80.34 
 
 
179 aa  283  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0713  superoxide dismutase, Cu-Zn  79.78 
 
 
179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2300  superoxide dismutase, Cu-Zn  79.78 
 
 
179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2986  superoxide dismutase, Cu-Zn  79.78 
 
 
179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1613  superoxide dismutase, Cu-Zn  79.78 
 
 
179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0859  superoxide dismutase, Cu-Zn  79.21 
 
 
216 aa  278  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3479  putative copper/zinc superoxide dismutase  73.53 
 
 
177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1018  superoxide dismutase copper/zinc binding  77.42 
 
 
177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0356333  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2188  superoxide dismutase copper/zinc binding  71.69 
 
 
206 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0161821  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.72 
 
 
177 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  37.71 
 
 
180 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  41.52 
 
 
171 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.67 
 
 
212 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.43 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.87 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.42 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  34.27 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.06 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  40.28 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.71 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  38 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.91 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  37.76 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.41 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.84 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  31.76 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.68 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  34.86 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.65 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.76 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.65 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.65 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.65 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.65 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.65 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.07 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.07 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.49 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  33.8 
 
 
172 aa  62.4  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  38.1 
 
 
200 aa  61.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.44 
 
 
165 aa  60.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.17 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  32.58 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.24 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.16 
 
 
180 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  30 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.6 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  31.43 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  33.54 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  30.11 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.52 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  31.11 
 
 
173 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  30.56 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  30.56 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.34 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  30.56 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  30.56 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  30.56 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  30.56 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.58 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.1 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  30 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.94 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  33.83 
 
 
185 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.36 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.85 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.54 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.06 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  29.55 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  31.91 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.38 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.38 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.38 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  30.71 
 
 
154 aa  48.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.91 
 
 
170 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  31.91 
 
 
170 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.91 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  32 
 
 
172 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  29.14 
 
 
173 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.81 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  32.87 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  35.04 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.83 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  29.14 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.61 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  29.14 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  29.14 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  29.14 
 
 
173 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.84 
 
 
169 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  26.52 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>