More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1397 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4514  patatin  98.21 
 
 		 751 aa  1440    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  97.12 
 
 		 728 aa  1405    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  81.06 
 
 		 733 aa  1189    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  72.83 
 
 		 728 aa  1050    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  92.03 
 
 		 727 aa  1337    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  73.16 
 
 		 728 aa  1087    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  73.28 
 
 		 728 aa  1051    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  100 
 
 		 728 aa  1466    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  39.81 
 
 		 745 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  38.71 
 
 		 777 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  35.16 
 
 		 741 aa  439  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  38.96 
 
 		 750 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.87 
 
 		 748 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  34.96 
 
 		 790 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  32.75 
 
 		 738 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  33.38 
 
 		 734 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.59 
 
 		 738 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  32.92 
 
 		 735 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  30.48 
 
 		 738 aa  354  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  30.2 
 
 		 737 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  30.2 
 
 		 738 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  30.2 
 
 		 738 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  33.56 
 
 		 753 aa  352  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.41 
 
 		 736 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  32.74 
 
 		 920 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  32.74 
 
 		 930 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.45 
 
 		 739 aa  350  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  31.07 
 
 		 751 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  34.29 
 
 		 767 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  31.36 
 
 		 738 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  32.71 
 
 		 737 aa  348  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  32.93 
 
 		 852 aa  348  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  31.36 
 
 		 738 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  32.88 
 
 		 933 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  32.88 
 
 		 945 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  32.88 
 
 		 728 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  30.12 
 
 		 735 aa  341  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  33.02 
 
 		 813 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  31.72 
 
 		 737 aa  337  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.41 
 
 		 754 aa  334  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  32.41 
 
 		 714 aa  329  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  32.48 
 
 		 804 aa  326  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.94 
 
 		 798 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  32.25 
 
 		 796 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  31.02 
 
 		 771 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  31.83 
 
 		 803 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  31.83 
 
 		 803 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  31.7 
 
 		 803 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  32.79 
 
 		 745 aa  319  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  30.7 
 
 		 776 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  32.23 
 
 		 729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  34.04 
 
 		 667 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  27.79 
 
 		 733 aa  292  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  30.53 
 
 		 764 aa  289  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  27.31 
 
 		 720 aa  225  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  33.41 
 
 		 740 aa  224  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  33.26 
 
 		 760 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  39.34 
 
 		 740 aa  221  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  31.61 
 
 		 746 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  39.07 
 
 		 707 aa  204  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  39.93 
 
 		 950 aa  193  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  39.59 
 
 		 923 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  32.53 
 
 		 981 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  37.5 
 
 		 894 aa  180  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  33.15 
 
 		 909 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  38.44 
 
 		 311 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  37.17 
 
 		 900 aa  173  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  36.96 
 
 		 358 aa  171  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  37.67 
 
 		 875 aa  170  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.36 
 
 		 256 aa  170  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  37.37 
 
 		 330 aa  170  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  36.2 
 
 		 260 aa  170  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.96 
 
 		 316 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  32.58 
 
 		 775 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  36.27 
 
 		 347 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  38.99 
 
 		 358 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  37.18 
 
 		 263 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  38.01 
 
 		 317 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  36.48 
 
 		 302 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  35.95 
 
 		 347 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  37.18 
 
 		 263 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  37.18 
 
 		 263 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  37.18 
 
 		 263 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  37.18 
 
 		 263 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  35.95 
 
 		 306 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  37.5 
 
 		 293 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  35.95 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  37.18 
 
 		 263 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  37.29 
 
 		 323 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  37.18 
 
 		 263 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  36.82 
 
 		 263 aa  165  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  35.95 
 
 		 347 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  36.84 
 
 		 349 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.6 
 
 		 333 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  37.33 
 
 		 315 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  36.1 
 
 		 263 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  36.49 
 
 		 302 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  37.41 
 
 		 311 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  36.82 
 
 		 263 aa  163  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.28 
 
 		 320 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>