More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2375 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  708    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  66.96 
 
 		 339 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.82 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  51.22 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  49.39 
 
 		 324 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  49.39 
 
 		 324 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  49.39 
 
 		 324 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  49.39 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  49.85 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  46.91 
 
 		 375 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  52.86 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  49.85 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  49.55 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  47.13 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  49.7 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2457  ThiJ/PfpI  62.1 
 
 		 236 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  43.85 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  42.2 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  44.92 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  43.61 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.89 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.89 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  45.89 
 
 		 345 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  43.16 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  45.35 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  45.73 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  42.01 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  44.14 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  49.69 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  42.38 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  49.38 
 
 		 369 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  49.38 
 
 		 369 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  42.19 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  40.9 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  46.53 
 
 		 333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  41.69 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  44.38 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  43.58 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  47.96 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  41.69 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  46.6 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  46.6 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  39.38 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  44.3 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 311 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  43.45 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  40.25 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  40.25 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 313 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 312 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>