More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1242 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  92.23 
 
 		 406 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  93.25 
 
 		 400 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  86 
 
 		 402 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  93.75 
 
 		 400 aa  703    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  764    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  85.93 
 
 		 402 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  85.5 
 
 		 402 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  81.2 
 
 		 402 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  84.14 
 
 		 399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  83.67 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  80.3 
 
 		 401 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  63.38 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  63.47 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  61.92 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  53.44 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  53.77 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  53.18 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  52.82 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  52.96 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  54.01 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  52.15 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  52.15 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  52.15 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  53.94 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  52.84 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  53 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  50.78 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 406 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 436 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  47.34 
 
 		 404 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  52.53 
 
 		 430 aa  348  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  46.95 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 417 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  47.63 
 
 		 480 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 410 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  48.2 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  51.81 
 
 		 405 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  46.91 
 
 		 412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  51.68 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 413 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  46.63 
 
 		 528 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 		 416 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 416 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 411 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 		 409 aa  299  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  47.93 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  47.93 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  47.93 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  47.93 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  47.93 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  47.93 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  47.93 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  41.28 
 
 		 421 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 433 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 412 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 415 aa  255  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  39.3 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  41.25 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 427 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  40.43 
 
 		 421 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 422 aa  156  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 414 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  30.36 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  31.5 
 
 		 430 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.62 
 
 		 435 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 437 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  31.19 
 
 		 452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>