250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2854 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  100 
 
 		 213 aa  430  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  51.87 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  46.7 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  47.83 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  45.5 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  43.2 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  35.35 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  36.15 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  33.96 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  30.81 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  30.81 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  30.81 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  30.81 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  30.81 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  30.81 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  30.81 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  30.81 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  33.49 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  30.81 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  34.47 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  33.64 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  30.33 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  35.87 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  34.72 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  33.49 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  32.54 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  34.42 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  32.54 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  33.97 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  33.8 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  31.46 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  33.18 
 
 		 295 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  29.86 
 
 		 237 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  30.14 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  31.05 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  35 
 
 		 377 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  29.2 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  32.08 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  30 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  31.34 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  31.05 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.52 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  29.68 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  30.56 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  28.71 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  30.26 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  30.77 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  31.1 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  33.17 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  30.77 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  30.53 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  33.18 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.13 
 
 		 291 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  31.05 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  32.06 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.97 
 
 		 280 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  31.39 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  29.91 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  29.91 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  31.43 
 
 		 189 aa  91.3  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.88 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  30 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  29.67 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  29.86 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  27.4 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  30.95 
 
 		 189 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  24.9 
 
 		 290 aa  89  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  29.25 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  33.19 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  33.19 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  27.4 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  26.76 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  30.92 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  28.95 
 
 		 275 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  28.51 
 
 		 275 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1133  cyclase family protein  31.25 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  29.73 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  32.11 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  30.56 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  30.48 
 
 		 189 aa  85.1  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  31 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  30.29 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  28.1 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  30.77 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  31.1 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  28.18 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  33.49 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  27.36 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  31.07 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  24.4 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  26.55 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  25.99 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  28.08 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  29.95 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  31.07 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  30.58 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  28.33 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  26.42 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>