More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4557 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 458 aa  914    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.31 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  43.42 
 
 		 463 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  42.43 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  40.75 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  36.77 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  40.68 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  40.64 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 		 480 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 463 aa  279  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  37.08 
 
 		 463 aa  266  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 462 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 480 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 474 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 471 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 475 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 467 aa  254  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.3 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 481 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  42.81 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  42.22 
 
 		 436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  34.98 
 
 		 465 aa  243  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  42.22 
 
 		 484 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  42.22 
 
 		 484 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 461 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  38.23 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 468 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  41.95 
 
 		 431 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 481 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.87 
 
 		 464 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 474 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  38.49 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2389  heavy metal sensor kinase  36.47 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.51 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2102  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  35.43 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  35.2 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  35.2 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  35.2 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  35.2 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  35.2 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  38.35 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.26 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  39.08 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  33.84 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  37.82 
 
 		 715 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 469 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 469 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 458 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 466 aa  227  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  40.46 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  36.39 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  36.39 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  40.2 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  36.39 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 458 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  33.85 
 
 		 462 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 464 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  40.14 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  36.09 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  35.98 
 
 		 482 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 487 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 486 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 480 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  38.28 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 469 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  34.35 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>