More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1241 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.41 
 
 
274 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.93 
 
 
263 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.15 
 
 
269 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.54 
 
 
263 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  69.77 
 
 
261 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.65 
 
 
263 aa  258  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.31 
 
 
276 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
263 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.53 
 
 
247 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
265 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
254 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.44 
 
 
246 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  41.6 
 
 
266 aa  188  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
259 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.03 
 
 
246 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
246 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 
257 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 
257 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 
257 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
246 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
247 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
249 aa  179  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
258 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
269 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.27 
 
 
247 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.08 
 
 
246 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 
269 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
257 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
257 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
254 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  41.6 
 
 
254 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
275 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
249 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  42.98 
 
 
255 aa  175  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
253 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.28 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.73 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
264 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0960385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
248 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
251 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.55 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.56 
 
 
247 aa  171  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
244 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
263 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
263 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 
245 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
263 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
263 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
248 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
255 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
263 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
248 aa  170  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2858  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.08 
 
 
246 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
252 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
247 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
260 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  44.22 
 
 
252 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
286 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
245 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
252 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
252 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
256 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
248 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 
255 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.56 
 
 
249 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
270 aa  168  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 
250 aa  168  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
246 aa  168  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
254 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.9 
 
 
247 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
256 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
249 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.08 
 
 
239 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
246 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  42.97 
 
 
261 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.49 
 
 
252 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  41.29 
 
 
265 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
253 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
251 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
256 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.18 
 
 
245 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
257 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
251 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.63 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>