More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0013 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  76.5 
 
 		 436 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 433 aa  883    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  66.75 
 
 		 416 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  68.91 
 
 		 416 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  64.46 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  61.45 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  58.72 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  61.54 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  61.43 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  56.94 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  56.94 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  56.94 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  56.94 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  56.7 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  57.79 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  55.78 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  56.03 
 
 		 400 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  56.53 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  58.65 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  55.21 
 
 		 413 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  55.21 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  55.21 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  53.9 
 
 		 413 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  55.21 
 
 		 413 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  54.96 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  54.74 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  54.96 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  54.72 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  54.72 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  54.72 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  54.39 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  57.82 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  54.68 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  54.61 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  54.77 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  54.89 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  51.5 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  42.13 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  39.16 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  37.28 
 
 		 397 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  42.9 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  41 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  36.73 
 
 		 451 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  42.86 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  41.43 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  41.43 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  41.43 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  41.43 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  39.64 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  41.43 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  42.15 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  40.57 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  42.15 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  42.15 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  40.11 
 
 		 426 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  42.15 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.04 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  42.15 
 
 		 424 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  40.85 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  42.15 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  42.66 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  42.15 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  41.86 
 
 		 424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  38.92 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  41.44 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.05 
 
 		 422 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.04 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  36.74 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.92 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.87 
 
 		 409 aa  189  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  37.87 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  41.69 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  36 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.88 
 
 		 396 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  35.54 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  35.07 
 
 		 386 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.9 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.52 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  33.43 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  31.89 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.61 
 
 		 478 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  32.72 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  30.98 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.9 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  33.52 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.23 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.57 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.76 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  30.71 
 
 		 481 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.61 
 
 		 479 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0180  putative cardiolipin synthetase  31.97 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.57 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2014  cardiolipin synthetase  31.97 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  31.77 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.56 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  32.3 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.4 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.8 
 
 		 479 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>