More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0129 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 417 aa  803    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  61.18 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  58.67 
 
 		 444 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  58.43 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  61.43 
 
 		 410 aa  484  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  58.67 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  58.19 
 
 		 444 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  58.6 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  58.23 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  58.23 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  58.23 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  59.35 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  57.52 
 
 		 443 aa  475  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  57.36 
 
 		 433 aa  471  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  58.17 
 
 		 430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  56.9 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  48.77 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  48.28 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  47.42 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  47.43 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  49.24 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  47.43 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  47.19 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  47.19 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  46.32 
 
 		 416 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  48.85 
 
 		 409 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  45.69 
 
 		 442 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  46.21 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  49.73 
 
 		 449 aa  358  9e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  47.42 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  46.27 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  45.97 
 
 		 436 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  47.43 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  47.55 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  47.43 
 
 		 417 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  47.84 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  46.76 
 
 		 424 aa  350  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  44.58 
 
 		 445 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  46.44 
 
 		 416 aa  349  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  44.99 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  47.98 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  44.23 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  47.83 
 
 		 434 aa  346  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  47.06 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  47.3 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  44.29 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  43.23 
 
 		 440 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  43.23 
 
 		 440 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.96 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  42.99 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  43.23 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  43.3 
 
 		 437 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  43.86 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  46.67 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  45.01 
 
 		 411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  44.05 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  44.05 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  44.77 
 
 		 411 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  44.77 
 
 		 411 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.77 
 
 		 411 aa  333  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.77 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  44.77 
 
 		 411 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  44.77 
 
 		 411 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  45.26 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  44.53 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  44.77 
 
 		 411 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  43.91 
 
 		 441 aa  332  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  46.75 
 
 		 413 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  47.39 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.92 
 
 		 409 aa  329  6e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  46.72 
 
 		 409 aa  324  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  44.6 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  47.44 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  42.59 
 
 		 430 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  41.57 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  41.33 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  42.33 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  40.33 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  42.03 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  45.39 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  41.71 
 
 		 452 aa  305  9.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  39.26 
 
 		 440 aa  302  9e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  42.79 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  38.74 
 
 		 425 aa  295  9e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  39.6 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.56 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  37.03 
 
 		 437 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  39.61 
 
 		 444 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  39.37 
 
 		 444 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  36.82 
 
 		 439 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  36.56 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  37.03 
 
 		 444 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  38.11 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  38.05 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  37.97 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  37.77 
 
 		 438 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  39.67 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  37.97 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.91 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>