More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0389 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  732    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  59.17 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  54.44 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  51.82 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  53.22 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  45.94 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  42.34 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  32.49 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  26.76 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  27.67 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  24.93 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  27.43 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  26.51 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  26.63 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.93 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  26.68 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  27.56 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  27.66 
 
 		 394 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  26.03 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  25.61 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 792 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.25 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  20.9 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.78 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  26.04 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.35 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  23.78 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.41 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  25.07 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  22.25 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  21.25 
 
 		 358 aa  85.9  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.4 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  25.15 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  23.72 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.2 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  23.39 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.53 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  21.37 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.55 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 1040 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.39 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  23.71 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  19.9 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.05 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  23.5 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  21.72 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  23.24 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  24.8 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  23 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  24.93 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  23.36 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  24.26 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  23.68 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.23 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  23.36 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  23.21 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>