More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2218 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 264 aa  550  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  45.61 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  47.21 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  43.92 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  45.73 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  41.83 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  41.96 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  43.51 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  43.48 
 
 		 268 aa  208  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  38.64 
 
 		 261 aa  205  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  43.23 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  42.86 
 
 		 265 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  44.18 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  41.73 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  42.69 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  43.21 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  42.24 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  42.35 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  40.91 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  41.77 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  41.73 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  39.58 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  43.17 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  37.3 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  40.76 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  38.11 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  38.26 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  35.5 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  35.96 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  34.91 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  35.47 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  35.04 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  33.62 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  34.03 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  38.16 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  33.62 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  33.62 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  33.48 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  34.31 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  37.2 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  33.19 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  34.04 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  32.38 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  30.86 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  30.96 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  33.98 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  31.73 
 
 		 246 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  31.42 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  32.92 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  31.42 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  30.54 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  33.05 
 
 		 234 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  34.32 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  31.91 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  32.91 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  37.39 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.84 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  33.81 
 
 		 245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  32.06 
 
 		 237 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  32.49 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  28.93 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  26.89 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  27.98 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  31.2 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  29.26 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 227 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  26.44 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  31.22 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  29.33 
 
 		 214 aa  96.3  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  27.94 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  27.94 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  27.94 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  26.61 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  29.54 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  28.05 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  29.68 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  29.3 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  26 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  28.03 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  28.44 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  27.72 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  29.68 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  29.68 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  28.03 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>