250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2186 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  40.18 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  39.32 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  39.9 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  39.32 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  40.21 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  40.45 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  35.74 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1878  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  43.22 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  37.85 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  38.28 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  37.62 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  37.62 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  41.77 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0985  flagellar hook capping protein  37.64 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1494  flagellar hook capping protein  40.58 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  37.91 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  39.69 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  36.27 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  33.66 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  36.79 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0601  flagellar hook capping protein  39.49 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3964  flagellar hook capping protein  36.4 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4118  flagellar hook capping protein  34.27 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0693  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  33.85 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  37.11 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  35.35 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  39.55 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  36.49 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  32.02 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  36.6 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  33.8 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  40.79 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  35.94 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  34.54 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  34.94 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  34.54 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  32.02 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  37.82 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  34.3 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  30.89 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  39.53 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  35.94 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  35.94 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  37.66 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  35.42 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  35.98 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  35.42 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  35.42 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  35.6 
 
 		 277 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  35.6 
 
 		 277 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  35.6 
 
 		 277 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  35.6 
 
 		 277 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  41.01 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  38.82 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  41.01 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  33.99 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  34.91 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  34.18 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  34.9 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  33.14 
 
 		 284 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  32.2 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  29.17 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  27.71 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  32.97 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  32.97 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  32.97 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  32.97 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  32.97 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  35.38 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  34.9 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  35.9 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  39.44 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  27.37 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  30.2 
 
 		 293 aa  84.7  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  27.75 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  27.75 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  32.03 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  35.58 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  29.69 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  36.91 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  30.57 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  34.97 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  34.97 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  34.97 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  34.97 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  36.36 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  34.97 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  34.97 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  34.97 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  36.77 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>