288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1475 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  1e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
156 aa  183  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  55.35 
 
 
156 aa  176  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 
155 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
155 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 
155 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  53.12 
 
 
160 aa  161  4e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 
160 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 
160 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
155 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
170 aa  158  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 
160 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
160 aa  154  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
160 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
160 aa  150  6e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
160 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 
162 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 
160 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 
160 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  51.06 
 
 
137 aa  146  1e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 
162 aa  145  2e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
160 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 
185 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
160 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  51.25 
 
 
160 aa  139  1e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
165 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
154 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
165 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 
160 aa  137  5e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  44.25 
 
 
174 aa  137  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  44.97 
 
 
169 aa  137  8e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  137  8e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  47.5 
 
 
152 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  44.03 
 
 
156 aa  134  7e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  45 
 
 
164 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
165 aa  132  2e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.42 
 
 
160 aa  114  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 
159 aa  113  1e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 
147 aa  112  2e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  35.12 
 
 
159 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  41.51 
 
 
140 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  38.65 
 
 
159 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
135 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  38.75 
 
 
156 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 
159 aa  110  7e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  33.94 
 
 
159 aa  109  1e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  43.21 
 
 
152 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  37.72 
 
 
159 aa  108  4e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 
159 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 
159 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 
165 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  38.27 
 
 
177 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 
156 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  39.62 
 
 
141 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  38.12 
 
 
154 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 
159 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  32.7 
 
 
156 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  45.97 
 
 
156 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  36.71 
 
 
154 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  39.62 
 
 
156 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  40.85 
 
 
156 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  40.85 
 
 
156 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  40.85 
 
 
156 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  40.85 
 
 
156 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  40.85 
 
 
156 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  40.85 
 
 
156 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  40.85 
 
 
156 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  40.49 
 
 
156 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  40.49 
 
 
156 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 
156 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  40.49 
 
 
156 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 
156 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 
156 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 
156 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  33.94 
 
 
159 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  39.75 
 
 
154 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  42.24 
 
 
158 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  41.25 
 
 
153 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 
156 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  39.52 
 
 
159 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  49.52 
 
 
156 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
159 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
159 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  49.52 
 
 
156 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  39.29 
 
 
156 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  50.93 
 
 
156 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  34.81 
 
 
153 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.67091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  39.63 
 
 
156 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  33.95 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  33.95 
 
 
159 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  39.02 
 
 
159 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  35.44 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.55884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  34.52 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  35.62 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  37.11 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  30.95 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  37.95 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  39.87 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.47821e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>