87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1157 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  41.32 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  39.06 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  39.79 
 
 		 350 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  30.9 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.09 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  29.86 
 
 		 661 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  28.4 
 
 		 897 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.77 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  28.36 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  33.67 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.61 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  29.17 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  30.68 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  32.66 
 
 		 931 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.46 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  27.53 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  35.53 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  30.5 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.21 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  28.99 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.3 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.64 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  28.21 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1140 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  29.7 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.08 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  35.2 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  34.38 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.08 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  28.23 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.68 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  28.07 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  25.58 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.59 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  30.89 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  28.96 
 
 		 698 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  32.02 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  29.44 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  32.02 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.13 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  30.86 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.8 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.56 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.68 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  32.02 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  28.17 
 
 		 363 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  25.77 
 
 		 3320 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  28.46 
 
 		 614 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  32.4 
 
 		 340 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1030 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  32.1 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  30.77 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.85 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  27.63 
 
 		 363 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  30.77 
 
 		 288 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  31.78 
 
 		 744 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  25 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  24.35 
 
 		 714 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 2082 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1024 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  30.09 
 
 		 368 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  26.09 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  24.63 
 
 		 742 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  30.25 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  30.63 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.62 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  24.75 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.08 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.27 
 
 		 681 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2020  hypothetical protein  24.78 
 
 		 344 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>