More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1972 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  100 
 
 
349 aa  705  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  60.74 
 
 
349 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  58.7 
 
 
343 aa  405  1e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.80746e-07  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  58.38 
 
 
353 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  58.73 
 
 
336 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  56.43 
 
 
343 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  56.03 
 
 
348 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  56.03 
 
 
348 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  56.03 
 
 
348 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  58.19 
 
 
337 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.73214e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  56.64 
 
 
337 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.82338e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  59.64 
 
 
338 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.34628e-08  unclonable  7.65641e-11 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  59.59 
 
 
353 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.39e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  54.02 
 
 
348 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  59.04 
 
 
338 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.60799e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  57.06 
 
 
342 aa  378  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.59076e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  53.33 
 
 
348 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  52.3 
 
 
348 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  53.45 
 
 
348 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  2.88065e-08 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  57.67 
 
 
353 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.8636e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  58.43 
 
 
353 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  59.04 
 
 
338 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.01356e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  55.33 
 
 
340 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  59.34 
 
 
338 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29962e-06  unclonable  2.62337e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  58.73 
 
 
338 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  56.32 
 
 
347 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  3.53353e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  60.2 
 
 
330 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.78362e-06  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  56.93 
 
 
338 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  59.64 
 
 
343 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.70796e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  54.99 
 
 
349 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  3.87336e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  59.04 
 
 
338 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.22492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  54.99 
 
 
349 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  59.04 
 
 
338 aa  362  7e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.1118e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  52.01 
 
 
348 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  57.06 
 
 
344 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  54.44 
 
 
349 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.80069e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  54.7 
 
 
349 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  54.7 
 
 
349 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40347e-14 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  54.7 
 
 
349 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  54.42 
 
 
349 aa  358  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  54.42 
 
 
349 aa  356  3e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  51.03 
 
 
339 aa  353  3e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  50.73 
 
 
339 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  50.14 
 
 
339 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  49.86 
 
 
339 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  54.44 
 
 
348 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.37079e-13 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  54.44 
 
 
348 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  54.44 
 
 
348 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17623e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  54.44 
 
 
348 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  54.15 
 
 
348 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.383e-07 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  51.3 
 
 
347 aa  342  5e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  49.57 
 
 
340 aa  340  3e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  49.32 
 
 
365 aa  338  7e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38973e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  49.57 
 
 
340 aa  336  4e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  47.14 
 
 
353 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  2.85162e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  51.45 
 
 
347 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  52.58 
 
 
340 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  47.72 
 
 
338 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  45.71 
 
 
342 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  47.42 
 
 
338 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  48.68 
 
 
341 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  48.39 
 
 
341 aa  312  6e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  45.76 
 
 
356 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  48.28 
 
 
339 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  51.93 
 
 
324 aa  302  7e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  58.02 
 
 
332 aa  299  6e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  6.96502e-10 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  58.67 
 
 
326 aa  295  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  49.67 
 
 
312 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  49.67 
 
 
312 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  44.58 
 
 
325 aa  291  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  42.25 
 
 
333 aa  286  3e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  42.9 
 
 
334 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  52.44 
 
 
332 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  43.28 
 
 
349 aa  279  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  44.97 
 
 
334 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  44.97 
 
 
334 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  48.25 
 
 
347 aa  275  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  43.12 
 
 
335 aa  274  1e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  50.46 
 
 
216 aa  202  8e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  50.72 
 
 
234 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  41.82 
 
 
165 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.3 
 
 
625 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  32.02 
 
 
316 aa  96.3  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.5 
 
 
595 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  32.75 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  29.73 
 
 
593 aa  92.8  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  32.99 
 
 
552 aa  92.8  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.81 
 
 
547 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  31.42 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  30.77 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.66 
 
 
596 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  29.6 
 
 
364 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  32.53 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  29.6 
 
 
364 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  30.98 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  35.57 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  28.74 
 
 
302 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  27.37 
 
 
327 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  32.56 
 
 
601 aa  85.9  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  30.3 
 
 
621 aa  85.5  1e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>