More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0677 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  77.71 
 
 		 176 aa  294  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  44.38 
 
 		 180 aa  157  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  43.96 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  36.99 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.32 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  40.11 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  35.96 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.43 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.07 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  32.58 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  32.58 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  36.78 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  36.57 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.58 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  36.26 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  32.58 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.74 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  31.46 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  35.56 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  31.46 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.36 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 		 192 aa  98.2  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  31.46 
 
 		 173 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  30.9 
 
 		 173 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.24 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 		 182 aa  97.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.9 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 		 192 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  33.68 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  30.51 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  33.51 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  29 
 
 		 195 aa  94.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.09 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.98 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.44 
 
 		 181 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  31.32 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.85 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.43 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.73 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  30.5 
 
 		 196 aa  88.2  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 		 184 aa  87.8  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.11 
 
 		 180 aa  87.8  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  32.79 
 
 		 192 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.56 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  32.78 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  32.81 
 
 		 190 aa  84.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.46 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.64 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.46 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.39 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  30.46 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.94 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  31.55 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.67 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.35 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  29.26 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>