96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0143 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
305 aa  629  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  26.13 
 
 
204 aa  63.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  35.62 
 
 
248 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.75 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  26.83 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  27.23 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  27.03 
 
 
194 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  29.9 
 
 
204 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  30.1 
 
 
202 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  32.05 
 
 
398 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.67 
 
 
183 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.11 
 
 
219 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  27.13 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  29.27 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  26.23 
 
 
233 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  29.38 
 
 
195 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  27.92 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.95 
 
 
673 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.93 
 
 
216 aa  53.1  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  25.91 
 
 
213 aa  52.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  25.52 
 
 
213 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
249 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  25.65 
 
 
203 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  25.6 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  26.46 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  25.41 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  23.71 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  26.23 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  27.5 
 
 
520 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  24.61 
 
 
218 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  35.94 
 
 
479 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  25.41 
 
 
216 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  26.74 
 
 
223 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  30.12 
 
 
679 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  27.92 
 
 
214 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.52 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  27.75 
 
 
275 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  25.14 
 
 
223 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.95 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  26.6 
 
 
202 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.47 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.27 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  24.19 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  27.4 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  28.57 
 
 
201 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.92 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  23.2 
 
 
208 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
681 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.97 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  28.57 
 
 
615 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  26.87 
 
 
275 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  26.96 
 
 
240 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  26.15 
 
 
218 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.52 
 
 
204 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  29.91 
 
 
214 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  23.2 
 
 
208 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  31.71 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  25.53 
 
 
516 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  29.11 
 
 
908 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  26.95 
 
 
447 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  26.87 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  27.81 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  26.2 
 
 
424 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3224  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
231 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  28.92 
 
 
545 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  32.89 
 
 
595 aa  45.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  28.21 
 
 
258 aa  45.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.48 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  25.52 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  27.71 
 
 
685 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  23.88 
 
 
797 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  26.97 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  29.13 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2976  lipolytic protein G-D-S-L family  26.09 
 
 
231 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  25.15 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  28.95 
 
 
689 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  23.68 
 
 
202 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  23.61 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  26.82 
 
 
921 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  26.95 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  26.67 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  25.12 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  24.43 
 
 
241 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  32.31 
 
 
1270 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  26.51 
 
 
468 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  25.81 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  24.88 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  26.38 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  28.79 
 
 
1162 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1204  hypothetical protein  28.26 
 
 
782 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.980122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  25.64 
 
 
763 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  27.21 
 
 
759 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.94 
 
 
211 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2000  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.81 
 
 
243 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.13 
 
 
198 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>