65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1722 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  100 
 
 
202 aa  413  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  50.76 
 
 
216 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  42.64 
 
 
207 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3233  hypothetical protein  40.76 
 
 
184 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.826377  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2845  lipolytic protein G-D-S-L family  40.96 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1227  lipolytic protein G-D-S-L family  34.34 
 
 
200 aa  121  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1216  acyl-CoA thioesterase I precursor  33.66 
 
 
199 aa  101  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1269  GDSL family lipase  32.99 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1807  hypothetical protein  33.02 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18470  hypothetical protein  30.41 
 
 
224 aa  94.7  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0868279  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09530  hypothetical protein  32.02 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19430  lysophospholipase L1-like esterase  31.44 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2490  acyl-CoA thioesterase I precursor  28.71 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  30.88 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2646  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07720  hypothetical protein  27.5 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.158265  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  31.07 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  31.07 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2380  hypothetical protein  27.55 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000388199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  28.71 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  26.05 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.64 
 
 
232 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  27.93 
 
 
239 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0102  arylesterase  28.3 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07271  lysophospholipase L1 and related esterases  28.3 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0199711  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07831  lysophospholipase L1 and related esterase  27.4 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  27.09 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14281  lysophospholipase L1  27.18 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07431  lysophospholipase L1 and related esterase  22.27 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.833835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  29.57 
 
 
233 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  23.08 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  22.95 
 
 
266 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  24.48 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0670  hypothetical protein  21.36 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212223  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1291  hypothetical protein  24.27 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07231  lysophospholipase L1 and related esterase  21.36 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.613017  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07251  lysophospholipase L1  21.63 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537242  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.53 
 
 
270 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  24.74 
 
 
204 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  27.46 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  26.49 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1186  hypothetical protein  26.57 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  25.77 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5580  putative lipase/acylhydrolase  23.29 
 
 
269 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  23.68 
 
 
305 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  25.37 
 
 
213 aa  45.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  28.92 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5427  putative lipase/acylhydrolase  22.37 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.387496  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5099  lipase/acylhydrolase  22.37 
 
 
269 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5253  lipase/acylhydrolase  22.37 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5496  putative lipase/acylhydrolase  22.37 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5651  lipase/acylhydrolase  22.37 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5082  lipase/acylhydrolase  22.37 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000543615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5530  lipase/acylhydrolase, putative  22.37 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  25.46 
 
 
254 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  24.05 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.32 
 
 
228 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  23.33 
 
 
214 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  27.45 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  22.44 
 
 
270 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  25.27 
 
 
208 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  24.19 
 
 
240 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  25 
 
 
294 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
456 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  26.78 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>