88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4794 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4794  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 114 aa  231  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103308  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1000  pentapeptide repeat-containing protein  75.44 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000366371  unclonable  5.80978e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0840  pentapeptide repeat-containing protein  72.57 
 
 		 114 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000049264  decreased coverage  0.0000626764 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_0975  pentapeptide repeat domain protein  71.68 
 
 		 114 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000613608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5418  hypothetical protein  70.27 
 
 		 115 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0625399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62240  hypothetical protein  70.27 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000219088  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0677  pentapeptide repeat-containing protein  57.55 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3061  pentapeptide repeat-containing protein  46.85 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 438 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 		 447 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.97 
 
 		 286 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  41.82 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  39.68 
 
 		 315 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  43.64 
 
 		 1831 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  44.64 
 
 		 870 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  44.83 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  31.73 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.29 
 
 		 745 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  34.69 
 
 		 635 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36.21 
 
 		 333 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  41.18 
 
 		 563 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 		 315 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  36.21 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  41.18 
 
 		 563 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24671  hypothetical protein  44.26 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.05 
 
 		 412 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.11 
 
 		 14916 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  33.8 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 		 420 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  44.44 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  44.44 
 
 		 273 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  44.44 
 
 		 273 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  44.44 
 
 		 273 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  41.38 
 
 		 325 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  41.38 
 
 		 273 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40.98 
 
 		 489 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  36.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.55 
 
 		 381 aa  43.5  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  43.1 
 
 		 442 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 973 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  37.74 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  30.19 
 
 		 215 aa  42  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  36.14 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  39.06 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  39.62 
 
 		 267 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 		 497 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 567 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 412 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  31.71 
 
 		 273 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3668  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 		 699 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.68 
 
 		 213 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 		 262 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  32.05 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 		 359 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.97 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  38.33 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  32.05 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  33.75 
 
 		 392 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 521 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  46.3 
 
 		 299 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  42.31 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 		 844 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  36.11 
 
 		 600 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  40.74 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  43.64 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 		 277 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 266 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2142  pentapeptide repeat-containing protein  41.51 
 
 		 202 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 432 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>