32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0975 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0975  pentapeptide repeat domain protein  100 
 
 		 114 aa  233  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000613608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0840  pentapeptide repeat-containing protein  92.11 
 
 		 114 aa  217  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000049264  decreased coverage  0.0000626764 
 
 
 
NC_009439  Pmen_1000  pentapeptide repeat-containing protein  73.45 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000366371  unclonable  5.80978e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4794  pentapeptide repeat-containing protein  71.68 
 
 		 114 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103308  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5418  hypothetical protein  68.47 
 
 		 115 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0625399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62240  hypothetical protein  67.57 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000219088  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0677  pentapeptide repeat-containing protein  55.86 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3061  pentapeptide repeat-containing protein  45.95 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.84 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 438 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  35.8 
 
 		 870 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.77 
 
 		 14916 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  29.27 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  31.08 
 
 		 172 aa  43.5  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  25.68 
 
 		 359 aa  42.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  37.74 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.11 
 
 		 576 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 		 256 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 213 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  32 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 420 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 		 389 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 		 333 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 259 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 256 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  27.03 
 
 		 156 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.47 
 
 		 309 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  28.38 
 
 		 600 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>