71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5418 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5418  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0625399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62240  hypothetical protein  95.61 
 
 		 115 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000219088  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1000  pentapeptide repeat-containing protein  71.17 
 
 		 118 aa  170  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000366371  unclonable  5.80978e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0840  pentapeptide repeat-containing protein  69.37 
 
 		 114 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000049264  decreased coverage  0.0000626764 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_0975  pentapeptide repeat domain protein  68.47 
 
 		 114 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000613608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4794  pentapeptide repeat-containing protein  70.27 
 
 		 114 aa  159  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103308  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0677  pentapeptide repeat-containing protein  56.48 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3061  pentapeptide repeat-containing protein  48.21 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  50 
 
 		 600 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.84 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  40.7 
 
 		 438 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 14916 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  47.46 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  37.18 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  30.99 
 
 		 359 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  35.21 
 
 		 521 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  38.27 
 
 		 290 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.14 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  33.75 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  40.74 
 
 		 563 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31.07 
 
 		 449 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  53.19 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  40.74 
 
 		 563 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  36.11 
 
 		 526 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 401 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 401 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  43.33 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 489 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 870 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  44.23 
 
 		 567 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.83 
 
 		 277 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  33.33 
 
 		 273 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  43.28 
 
 		 844 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  35.38 
 
 		 181 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 210 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  48.15 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  34.18 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.18 
 
 		 286 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 292 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  43.86 
 
 		 973 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  38.6 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  39.06 
 
 		 412 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  43.55 
 
 		 412 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 		 299 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 447 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 448 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  34.52 
 
 		 180 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.86 
 
 		 333 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  53.06 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 371 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  41.07 
 
 		 745 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 371 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  32.98 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1003 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>