More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2739 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  52.75 
 
 		 223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  52.75 
 
 		 223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  51.83 
 
 		 223 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  52.28 
 
 		 292 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  43.58 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  41.2 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  43.33 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  41.74 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  41.74 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  41.74 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  39.72 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  45.64 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  40.24 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  39.63 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  36.65 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  38.99 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  38.89 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  35.5 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  38.76 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39.52 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  38.33 
 
 		 318 aa  101  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  40.61 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  39.18 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  39.18 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  37.5 
 
 		 246 aa  98.2  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  37.71 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  39.89 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  34.43 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  38.01 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  41.62 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  36.26 
 
 		 240 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  38.76 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  35.12 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  37.71 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.88 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  36.09 
 
 		 249 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  36.09 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  36.09 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  36.09 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  36.09 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  36.09 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  36.09 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  36.31 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  36.31 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  40 
 
 		 267 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  36.21 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  36.57 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  38.2 
 
 		 217 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.64 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  36.42 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  32.42 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  36.02 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  35.93 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  35.54 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  36.69 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  36.69 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  36.69 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  38.92 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  31.8 
 
 		 382 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  35.09 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  35.84 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  35.84 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  33.9 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  36.12 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  35.88 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.83 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  31.56 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  37.28 
 
 		 284 aa  88.2  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  31.56 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.88 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  32.76 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  31.36 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  37.95 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  34.3 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  35 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  35.09 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  35.88 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 206 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  33.67 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  32.97 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  31.11 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  31.36 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>