245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2399 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  78.4 
 
 		 427 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  79.38 
 
 		 427 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 427 aa  822    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  79.38 
 
 		 427 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  75.54 
 
 		 427 aa  621  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  73.3 
 
 		 429 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  77.99 
 
 		 427 aa  617  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  77.67 
 
 		 427 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  79.18 
 
 		 427 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  79.18 
 
 		 427 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  74.88 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  74.88 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  80.79 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  75.12 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  74.51 
 
 		 426 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  75.79 
 
 		 426 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  73.71 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  74.24 
 
 		 429 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  74 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  72.37 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  73.3 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  74 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  70.02 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  73.54 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  69.12 
 
 		 435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  74.33 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  74.09 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  74.58 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  69.25 
 
 		 433 aa  552  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  68.96 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  66.99 
 
 		 430 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  65.31 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  61.72 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  61.72 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  66.75 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  61.3 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  62.15 
 
 		 434 aa  481  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  63.83 
 
 		 430 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  53.32 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  63.17 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  64.86 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  63.75 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  53.08 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  59.29 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  60.48 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  51.55 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  51.55 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  59.9 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  60.91 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  49.05 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  53.69 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  50.24 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  46.34 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  46.12 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  45.52 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  41.5 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  32.71 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  32.71 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  30.73 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  30.26 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  29.79 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  30.84 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  30.61 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  30.61 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  30.61 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  30.61 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  35.51 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  30.37 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  31.96 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  31.1 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  30.37 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  44.55 
 
 		 239 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  30.5 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  30.6 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  29.92 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  31.11 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  29.57 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  28.69 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  32.85 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  27.39 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  29.61 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  29.97 
 
 		 423 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  28.69 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.8 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  29.26 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  29.26 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  30.23 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  30.23 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  26.18 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  29.98 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  27.02 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  29.89 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  30.94 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>