More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1481 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.86 
 
 		 446 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  74.77 
 
 		 450 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  74.49 
 
 		 449 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.82 
 
 		 446 aa  718    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  893    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.59 
 
 		 446 aa  695    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.32 
 
 		 446 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.43 
 
 		 443 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  67.64 
 
 		 446 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  68.56 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  67.65 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 419 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.98 
 
 		 412 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  31.65 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  34.75 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  34.75 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 449 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  28.35 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  27.25 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  37.01 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  27.29 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  36.07 
 
 		 452 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  36.4 
 
 		 480 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  30.07 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  27.33 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.05 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  35.4 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 454 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  34.04 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  27.33 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  29.35 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  31.64 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 458 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  27.51 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  31.07 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  28.02 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  34.4 
 
 		 422 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  27.33 
 
 		 449 aa  146  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 427 aa  144  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 455 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  35.05 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 570 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 414 aa  137  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 422 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  34.15 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  33.22 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  35.07 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  35.09 
 
 		 422 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  35.4 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 427 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  33.43 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  33.11 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000859789  normal  0.518729 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  34.23 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  30.21 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  33.8 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  33.66 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1103  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000605909  normal  0.0234828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>