More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0081 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  80 
 
 		 505 aa  758    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  82.9 
 
 		 510 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  83.47 
 
 		 510 aa  799    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  79.76 
 
 		 508 aa  716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  80 
 
 		 510 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  74.56 
 
 		 523 aa  713    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  100 
 
 		 508 aa  988    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  76.13 
 
 		 523 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  80 
 
 		 510 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  75.94 
 
 		 523 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  55.76 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  53.21 
 
 		 522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  54.08 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  54.08 
 
 		 522 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  54.32 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  53.75 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  49.79 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  47.91 
 
 		 519 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  40.2 
 
 		 769 aa  299  7e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  41.38 
 
 		 726 aa  299  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  44.37 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  40.53 
 
 		 749 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  41.72 
 
 		 764 aa  295  9e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  41.13 
 
 		 783 aa  293  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  41.19 
 
 		 867 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  37.74 
 
 		 787 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  39.34 
 
 		 877 aa  265  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  37.65 
 
 		 534 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  37.77 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  35.8 
 
 		 519 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  40.24 
 
 		 526 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  38.11 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  33.46 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  37.35 
 
 		 531 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  40.98 
 
 		 754 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  37.87 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  36.98 
 
 		 547 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  33.8 
 
 		 548 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.98 
 
 		 515 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  36.98 
 
 		 515 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.98 
 
 		 515 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.98 
 
 		 515 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  36.98 
 
 		 515 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.98 
 
 		 515 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.98 
 
 		 515 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  36.85 
 
 		 516 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  36.85 
 
 		 516 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  34.37 
 
 		 525 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  37.43 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  36.47 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  35.87 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  36.18 
 
 		 527 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  37.55 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  38.37 
 
 		 516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  37.22 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  37.09 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  34.46 
 
 		 549 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  33.01 
 
 		 531 aa  206  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  35.27 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  30.33 
 
 		 756 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  35.38 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  32.53 
 
 		 542 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  38.21 
 
 		 498 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  33.2 
 
 		 768 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  33.2 
 
 		 768 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  37.68 
 
 		 573 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  37.77 
 
 		 739 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  30.71 
 
 		 560 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  30.53 
 
 		 549 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.97 
 
 		 579 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  35.38 
 
 		 564 aa  187  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  31.47 
 
 		 601 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  31.44 
 
 		 517 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  29.35 
 
 		 553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  33.87 
 
 		 532 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  32.61 
 
 		 532 aa  180  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  36.19 
 
 		 581 aa  180  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  35.41 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  35.41 
 
 		 572 aa  174  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  34.32 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  34.32 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  32.52 
 
 		 557 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  35.03 
 
 		 581 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  34.06 
 
 		 577 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  30.21 
 
 		 558 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  29.42 
 
 		 570 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  33.92 
 
 		 583 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  33.27 
 
 		 555 aa  164  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  30.79 
 
 		 568 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  35.25 
 
 		 568 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  34.15 
 
 		 767 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  31.19 
 
 		 554 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  32.7 
 
 		 558 aa  160  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  30.88 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  36.34 
 
 		 632 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  27.67 
 
 		 541 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  32.34 
 
 		 536 aa  158  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  30.37 
 
 		 568 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  36.34 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  27.65 
 
 		 553 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>