More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1103 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  67.28 
 
 		 441 aa  635    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.46 
 
 		 739 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 726 aa  1483    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.86 
 
 		 731 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  64.73 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.54 
 
 		 735 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.35 
 
 		 721 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  53.52 
 
 		 733 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.6 
 
 		 734 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.08 
 
 		 734 aa  562  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  55.99 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  55.4 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  53.97 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 437 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  51.47 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  51.61 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  53.69 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  55.56 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  53.08 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  51.26 
 
 		 435 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  48.63 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  48.4 
 
 		 429 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  48.63 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  48.74 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  52.02 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.39 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 435 aa  426  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  49.22 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  48.07 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 		 434 aa  422  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  50.72 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 434 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  49.32 
 
 		 448 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.26 
 
 		 432 aa  412  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  50.34 
 
 		 459 aa  412  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.08 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  48.05 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  48.85 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.27 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  46.21 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 440 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  48.03 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 		 439 aa  392  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  45.45 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  47.09 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.69 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  46.09 
 
 		 544 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  47.88 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  48.12 
 
 		 446 aa  379  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  47.74 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  47.74 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  45.82 
 
 		 461 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  47.47 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  45.85 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  48.44 
 
 		 448 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  45.97 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  46.79 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  46.28 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  45.84 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  46.22 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  44.47 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  48.56 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  44.89 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  46.76 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  45.18 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  49.64 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  46.22 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  48.33 
 
 		 449 aa  365  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  45.79 
 
 		 446 aa  365  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  45.29 
 
 		 443 aa  365  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 445 aa  365  2e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  44.34 
 
 		 447 aa  364  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  43.12 
 
 		 435 aa  364  4e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  45.81 
 
 		 429 aa  363  6e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  44.5 
 
 		 443 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  44.5 
 
 		 443 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  45.02 
 
 		 443 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  44.87 
 
 		 443 aa  361  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  45.02 
 
 		 443 aa  361  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  44.5 
 
 		 443 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  44.09 
 
 		 446 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  45.15 
 
 		 442 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 449 aa  360  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  46.82 
 
 		 435 aa  360  5e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  45.58 
 
 		 445 aa  360  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 441 aa  360  6e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  45.45 
 
 		 443 aa  360  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  43.51 
 
 		 445 aa  359  9e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 443 aa  359  9e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  46.54 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>