256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1428 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 
627 aa  1300    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  90.11 
 
 
629 aa  1189    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.47 
 
 
635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.61 
 
 
622 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  46.86 
 
 
632 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  47.48 
 
 
635 aa  550  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  47.67 
 
 
622 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.26 
 
 
634 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.33 
 
 
658 aa  528  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.33 
 
 
657 aa  531  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.87 
 
 
658 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.86 
 
 
625 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.44 
 
 
629 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.12 
 
 
659 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.34 
 
 
624 aa  492  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.43 
 
 
667 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  41.73 
 
 
662 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.77 
 
 
663 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  41.04 
 
 
664 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  40.61 
 
 
665 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  40.48 
 
 
664 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  40.31 
 
 
673 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.55 
 
 
591 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  34.86 
 
 
574 aa  313  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.45 
 
 
590 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.01 
 
 
594 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.23 
 
 
579 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.07 
 
 
566 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  30.55 
 
 
563 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  27.12 
 
 
574 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  26.7 
 
 
576 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.54 
 
 
556 aa  157  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  27.04 
 
 
574 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.9 
 
 
574 aa  150  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.9 
 
 
574 aa  150  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  27.14 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  27.58 
 
 
579 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  27.83 
 
 
579 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  27.1 
 
 
579 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  26.14 
 
 
574 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  26.05 
 
 
569 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  27.59 
 
 
579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  27.23 
 
 
579 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  27.43 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  25.75 
 
 
578 aa  124  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  25.24 
 
 
591 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  24.88 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  25.91 
 
 
954 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  24.61 
 
 
578 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  24.64 
 
 
582 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.52 
 
 
582 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  24.76 
 
 
583 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  25.16 
 
 
580 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.02 
 
 
610 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  31.76 
 
 
580 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  24.49 
 
 
573 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.68 
 
 
564 aa  87.8  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  22.03 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  23.24 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0636  putative succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.76 
 
 
648 aa  72.8  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.78 
 
 
583 aa  71.6  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.33 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.42 
 
 
577 aa  70.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.46 
 
 
575 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21 
 
 
598 aa  70.1  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.57 
 
 
566 aa  69.7  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.84 
 
 
541 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.07 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  21.48 
 
 
576 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.75 
 
 
575 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.01 
 
 
621 aa  65.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.918858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.93 
 
 
595 aa  64.3  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.17 
 
 
596 aa  64.3  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.82 
 
 
644 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.51 
 
 
638 aa  63.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.14 
 
 
601 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  24 
 
 
646 aa  63.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  20.07 
 
 
582 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.84 
 
 
648 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.46 
 
 
566 aa  61.6  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.9 
 
 
575 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.9 
 
 
575 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.79 
 
 
646 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.19 
 
 
595 aa  60.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  21.44 
 
 
584 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 
641 aa  60.8  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.69 
 
 
583 aa  60.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.84 
 
 
648 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.84 
 
 
648 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  22.01 
 
 
531 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.71 
 
 
627 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.36 
 
 
589 aa  60.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13349  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.31 
 
 
590 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.8 
 
 
583 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.32 
 
 
612 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.86 
 
 
579 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.17 
 
 
581 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  21.42 
 
 
531 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.71 
 
 
597 aa  58.9  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  21.64 
 
 
570 aa  58.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>