78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0872 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  60 
 
 		 667 aa  808    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.71 
 
 		 634 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.25 
 
 		 662 aa  777    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.65 
 
 		 665 aa  794    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  59.61 
 
 		 664 aa  806    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  59.46 
 
 		 663 aa  781    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.38 
 
 		 625 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  59.61 
 
 		 664 aa  788    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  61.35 
 
 		 657 aa  850    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  61.05 
 
 		 658 aa  842    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  60.42 
 
 		 658 aa  834    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 		 673 aa  1402    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  63.71 
 
 		 659 aa  840    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.15 
 
 		 624 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.66 
 
 		 635 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.23 
 
 		 629 aa  615  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  43.43 
 
 		 632 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.43 
 
 		 622 aa  525  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.84 
 
 		 622 aa  524  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.46 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  40 
 
 		 627 aa  478  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  40.15 
 
 		 629 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.67 
 
 		 591 aa  299  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.73 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.67 
 
 		 574 aa  293  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  29.26 
 
 		 563 aa  262  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.24 
 
 		 579 aa  260  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.23 
 
 		 566 aa  260  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.44 
 
 		 594 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  24.8 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  23.44 
 
 		 576 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  22.12 
 
 		 574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  22.12 
 
 		 574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  22.95 
 
 		 578 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  22.83 
 
 		 574 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  25.08 
 
 		 578 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  23.56 
 
 		 574 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  24.73 
 
 		 954 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  23.59 
 
 		 574 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  22.39 
 
 		 578 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  22.73 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  23.04 
 
 		 579 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  22.94 
 
 		 591 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  23.09 
 
 		 582 aa  99  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  21.89 
 
 		 579 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  22.06 
 
 		 579 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  22.26 
 
 		 579 aa  97.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  22.1 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  22.75 
 
 		 580 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  21.89 
 
 		 579 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  22.93 
 
 		 582 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  24.6 
 
 		 573 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.92 
 
 		 610 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  22.95 
 
 		 583 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.61 
 
 		 556 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  23.37 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  28.14 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.63 
 
 		 601 aa  54.3  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.1 
 
 		 626 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.82 
 
 		 599 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.31 
 
 		 536 aa  52.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  29.28 
 
 		 542 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.27 
 
 		 552 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.93 
 
 		 617 aa  50.8  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.41 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.02 
 
 		 606 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.85 
 
 		 608 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.11 
 
 		 589 aa  48.5  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.02 
 
 		 543 aa  47.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.69 
 
 		 576 aa  47.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  31.43 
 
 		 541 aa  47.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0312  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.86 
 
 		 585 aa  47  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.65 
 
 		 566 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22 
 
 		 580 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.96 
 
 		 564 aa  45.8  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.56 
 
 		 566 aa  45.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  21.38 
 
 		 537 aa  44.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.19 
 
 		 621 aa  44.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.918858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>