84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3198 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  81.6 
 
 		 662 aa  1129    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.64 
 
 		 658 aa  782    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  85.35 
 
 		 667 aa  1202    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  59.73 
 
 		 658 aa  792    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  55.43 
 
 		 634 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  82.23 
 
 		 665 aa  1157    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.15 
 
 		 635 aa  636    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  82.35 
 
 		 664 aa  1164    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  81.6 
 
 		 664 aa  1137    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.97 
 
 		 657 aa  795    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  59.46 
 
 		 673 aa  766    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.81 
 
 		 625 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 		 663 aa  1382    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  63.64 
 
 		 659 aa  858    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  53.55 
 
 		 629 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.91 
 
 		 624 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.73 
 
 		 622 aa  525  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  44.83 
 
 		 632 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.11 
 
 		 622 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.29 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.26 
 
 		 629 aa  473  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.77 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.51 
 
 		 590 aa  325  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.02 
 
 		 591 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.32 
 
 		 574 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.61 
 
 		 579 aa  275  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  29.37 
 
 		 566 aa  253  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.33 
 
 		 594 aa  249  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.34 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  24.45 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  22.45 
 
 		 576 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  22.49 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  22.55 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  22.49 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  22.17 
 
 		 579 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  22.33 
 
 		 579 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  22.26 
 
 		 579 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  21.86 
 
 		 579 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  21.7 
 
 		 574 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  22.07 
 
 		 579 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.08 
 
 		 556 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  21.9 
 
 		 579 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  21.28 
 
 		 574 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  21.9 
 
 		 579 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  22.78 
 
 		 578 aa  94.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  21.63 
 
 		 578 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  22.92 
 
 		 954 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  28.27 
 
 		 573 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  20.73 
 
 		 578 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.16 
 
 		 610 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  21.24 
 
 		 582 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  20.76 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  20.57 
 
 		 591 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  21.37 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  25.14 
 
 		 583 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  24.51 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  27 
 
 		 641 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.97 
 
 		 601 aa  51.6  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  24.69 
 
 		 536 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.99 
 
 		 598 aa  48.9  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  25.29 
 
 		 552 aa  48.5  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  22.44 
 
 		 534 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.21 
 
 		 600 aa  48.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  23.97 
 
 		 535 aa  47.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  23.14 
 
 		 537 aa  47.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  24.28 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  24.28 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  25 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  24.28 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.17 
 
 		 611 aa  47.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  24.28 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  24.28 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21330  succinate dehydrogenase subunit A  22.9 
 
 		 591 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  23.87 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  23.63 
 
 		 532 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  23.46 
 
 		 536 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  24.69 
 
 		 536 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  23.87 
 
 		 537 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  22.73 
 
 		 555 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2561  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.72 
 
 		 542 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.29 
 
 		 595 aa  44.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  23.87 
 
 		 537 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  22.94 
 
 		 541 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.92 
 
 		 590 aa  43.9  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>