85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2893 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  88.54 
 
 		 662 aa  1217    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.23 
 
 		 634 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  93.67 
 
 		 664 aa  1320    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  62.42 
 
 		 659 aa  854    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  57.84 
 
 		 658 aa  768    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  57.95 
 
 		 658 aa  773    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 		 665 aa  1395    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  91.1 
 
 		 664 aa  1263    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  57.1 
 
 		 657 aa  775    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  82.23 
 
 		 663 aa  1157    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  83.41 
 
 		 667 aa  1177    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.65 
 
 		 673 aa  777    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.32 
 
 		 635 aa  621  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  49.15 
 
 		 625 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.31 
 
 		 629 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  49.23 
 
 		 624 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.05 
 
 		 622 aa  525  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  43.94 
 
 		 632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.12 
 
 		 622 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.9 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  41.09 
 
 		 629 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  40.61 
 
 		 627 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.45 
 
 		 590 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.2 
 
 		 574 aa  312  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.22 
 
 		 591 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.86 
 
 		 579 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.83 
 
 		 594 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.96 
 
 		 566 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.8 
 
 		 563 aa  228  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  24.47 
 
 		 569 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  22.12 
 
 		 574 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  23.04 
 
 		 576 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  22.45 
 
 		 579 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  22.74 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  22.31 
 
 		 574 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  22.31 
 
 		 574 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  22.01 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  22.26 
 
 		 574 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  23.2 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  21.7 
 
 		 579 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  21.67 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  22.09 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  21.93 
 
 		 579 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  23.23 
 
 		 578 aa  97.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  23.09 
 
 		 954 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  22.02 
 
 		 578 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.7 
 
 		 556 aa  92.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  25.88 
 
 		 573 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.68 
 
 		 610 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  21.87 
 
 		 591 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  20.57 
 
 		 578 aa  87  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  22.47 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  21.58 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  21.86 
 
 		 582 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  21.42 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  23.65 
 
 		 583 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  24.04 
 
 		 534 aa  53.9  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  23.76 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  20.66 
 
 		 534 aa  50.8  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  23.65 
 
 		 536 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.4 
 
 		 600 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  20.79 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.1 
 
 		 564 aa  48.5  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.23 
 
 		 575 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3954  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.44 
 
 		 610 aa  48.5  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.88 
 
 		 593 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  22.82 
 
 		 537 aa  47.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.26 
 
 		 603 aa  47.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  23.65 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  23.65 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  23.65 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  23.65 
 
 		 537 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  23.24 
 
 		 536 aa  46.6  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  23.74 
 
 		 641 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.19 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.26 
 
 		 601 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  23.24 
 
 		 536 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  22.26 
 
 		 550 aa  44.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  22.07 
 
 		 561 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.37 
 
 		 576 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.32 
 
 		 602 aa  44.3  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.38 
 
 		 599 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.12 
 
 		 591 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.12 
 
 		 591 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  21.68 
 
 		 542 aa  43.9  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>