105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2129 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.4 
 
 		 673 aa  766    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.78 
 
 		 657 aa  797    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  87.18 
 
 		 664 aa  1210    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  53.38 
 
 		 634 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  89.46 
 
 		 664 aa  1252    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  63.69 
 
 		 659 aa  864    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  59.06 
 
 		 658 aa  789    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  59.54 
 
 		 658 aa  800    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  88.54 
 
 		 665 aa  1234    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 		 662 aa  1387    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  81.6 
 
 		 663 aa  1141    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.54 
 
 		 625 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  81.78 
 
 		 667 aa  1149    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.4 
 
 		 629 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.86 
 
 		 635 aa  631  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.54 
 
 		 624 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.19 
 
 		 622 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  44.7 
 
 		 632 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.85 
 
 		 635 aa  529  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.87 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  41.73 
 
 		 627 aa  475  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  40.97 
 
 		 629 aa  473  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.5 
 
 		 590 aa  321  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.45 
 
 		 591 aa  317  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.14 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.72 
 
 		 579 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.97 
 
 		 594 aa  263  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.34 
 
 		 566 aa  247  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.63 
 
 		 563 aa  232  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  23.2 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  23.18 
 
 		 576 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  21.75 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  23.65 
 
 		 578 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  22.91 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  21.33 
 
 		 579 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  22.14 
 
 		 574 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  22.12 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  22.12 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  21.17 
 
 		 579 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  21.01 
 
 		 579 aa  97.8  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  21.2 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  22.09 
 
 		 578 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.27 
 
 		 556 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  21.09 
 
 		 579 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  20.76 
 
 		 579 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  20.59 
 
 		 579 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  20.97 
 
 		 578 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  22.54 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  21.87 
 
 		 591 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  23.22 
 
 		 954 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  23.25 
 
 		 580 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  21.04 
 
 		 582 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  20.47 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.56 
 
 		 610 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  20.97 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  25.98 
 
 		 573 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  22.61 
 
 		 534 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.59 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  23.21 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  24.17 
 
 		 536 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.62 
 
 		 611 aa  51.2  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  25.17 
 
 		 555 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  23.38 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.98 
 
 		 601 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  24.75 
 
 		 641 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  24.17 
 
 		 536 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  24.73 
 
 		 531 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  24.82 
 
 		 542 aa  48.5  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3954  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.23 
 
 		 610 aa  48.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.14 
 
 		 600 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.85 
 
 		 605 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  26.14 
 
 		 542 aa  47.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  24.38 
 
 		 531 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  23.5 
 
 		 590 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.48 
 
 		 599 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.5 
 
 		 591 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.5 
 
 		 591 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  25.42 
 
 		 543 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.5 
 
 		 590 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  24.58 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.5 
 
 		 590 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.5 
 
 		 590 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  23.85 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.5 
 
 		 590 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.5 
 
 		 568 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  24.58 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  24.58 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  23.55 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  23.25 
 
 		 561 aa  47.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  24.58 
 
 		 537 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.58 
 
 		 584 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.84 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.48 
 
 		 599 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  24.27 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.53 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.58 
 
 		 601 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  23.3 
 
 		 531 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.39 
 
 		 602 aa  45.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  23.75 
 
 		 536 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  32.11 
 
 		 528 aa  44.7  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>