135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1885 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  69.45 
 
 
635 aa  901    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  54.29 
 
 
657 aa  692    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  74.92 
 
 
625 aa  944    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  68.91 
 
 
634 aa  899    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  76.63 
 
 
624 aa  959    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.99 
 
 
667 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 
629 aa  1305    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  53.53 
 
 
658 aa  681    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  54.6 
 
 
658 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  53.55 
 
 
663 aa  657    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.4 
 
 
662 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.92 
 
 
664 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.31 
 
 
664 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.31 
 
 
665 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.07 
 
 
659 aa  627  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.23 
 
 
673 aa  617  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.69 
 
 
635 aa  578  1.0000000000000001e-163  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.59 
 
 
622 aa  561  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  46.98 
 
 
632 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.98 
 
 
622 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.44 
 
 
627 aa  535  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.85 
 
 
629 aa  531  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.79 
 
 
590 aa  346  6e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.34 
 
 
591 aa  346  8e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  34.78 
 
 
574 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.74 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  33.12 
 
 
566 aa  303  8.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.59 
 
 
563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.95 
 
 
594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  26.75 
 
 
569 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.68 
 
 
574 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.68 
 
 
574 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  26.62 
 
 
574 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  25.56 
 
 
576 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  25.92 
 
 
574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  26 
 
 
579 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  25.83 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  25.86 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  25.83 
 
 
579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  26.33 
 
 
578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  25.88 
 
 
579 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  27.07 
 
 
578 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.64 
 
 
556 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  26.01 
 
 
579 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  27.05 
 
 
578 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  25.83 
 
 
579 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  25.83 
 
 
579 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.37 
 
 
582 aa  124  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25.37 
 
 
582 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  25.12 
 
 
580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  25.12 
 
 
954 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  24.71 
 
 
573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  24.72 
 
 
591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  25.36 
 
 
583 aa  105  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.41 
 
 
610 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  25.16 
 
 
580 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.98 
 
 
564 aa  77  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  20.86 
 
 
601 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.72 
 
 
575 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2561  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.73 
 
 
542 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.32 
 
 
578 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  24.8 
 
 
596 aa  61.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.01 
 
 
581 aa  61.2  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 
641 aa  60.8  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  25.81 
 
 
528 aa  60.1  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.62 
 
 
581 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.59 
 
 
562 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  22.69 
 
 
573 aa  59.3  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.94 
 
 
638 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  23.11 
 
 
542 aa  58.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.12 
 
 
575 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.74 
 
 
582 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  20.93 
 
 
532 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.54 
 
 
605 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  21.82 
 
 
575 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.02 
 
 
608 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  21.97 
 
 
576 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.47 
 
 
605 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  21.84 
 
 
570 aa  53.9  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.37 
 
 
627 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.32 
 
 
605 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.03 
 
 
617 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.46 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.49 
 
 
598 aa  53.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.18 
 
 
646 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  25.68 
 
 
633 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  24.46 
 
 
534 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  25.34 
 
 
528 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.56 
 
 
606 aa  50.4  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  26.18 
 
 
630 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.73 
 
 
589 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.66 
 
 
623 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.31 
 
 
626 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.73 
 
 
602 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  27.14 
 
 
576 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.79 
 
 
604 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0247  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.02 
 
 
575 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.828778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  25.24 
 
 
531 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.33 
 
 
637 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  20.84 
 
 
538 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>