113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1254 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  100 
 
 		 330 aa  671    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  73.94 
 
 		 333 aa  528  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  73.33 
 
 		 334 aa  525  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  75.68 
 
 		 329 aa  485  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  30.97 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  26.58 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  26.42 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  26.84 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1371  putative RNA methylase  27.59 
 
 		 408 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  26.86 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.67 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  26.45 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  29.62 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  25.23 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  26.52 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  27.73 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  26.34 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  24.48 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  23.42 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  27.12 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  27.91 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  34 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  27.57 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  25.19 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  25.65 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  23.11 
 
 		 484 aa  53.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  25.27 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  25.09 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  32.31 
 
 		 199 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  21.03 
 
 		 364 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  23.16 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  23.16 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  27.56 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  22.97 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0074  putative RNA methylase  18.94 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  25.96 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  23.89 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  31.13 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  24.7 
 
 		 384 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  21.84 
 
 		 706 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  23.9 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  32.93 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  23.95 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  20.87 
 
 		 706 aa  49.3  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  20.87 
 
 		 706 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  23.14 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  26.59 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0259  putative RNA methylase  29.27 
 
 		 480 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  31.71 
 
 		 430 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  23.67 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  23.95 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  23.14 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.25 
 
 		 484 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  22.76 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  22.09 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  23.79 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  26.4 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  23.14 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  23.14 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  23.14 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  23.14 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.58 
 
 		 484 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  22.39 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  22.39 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  21.36 
 
 		 706 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  23.14 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  23.14 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  22.73 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  22.15 
 
 		 389 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  22.31 
 
 		 379 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  22.07 
 
 		 388 aa  46.2  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  22.31 
 
 		 379 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.77 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.82 
 
 		 701 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  30.49 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  21.55 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  30.49 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  27.61 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  30.49 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  22.91 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  30.49 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  30.49 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  30.49 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  30.49 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  30.49 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  22.41 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  20.3 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  23.76 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  30.59 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  31.73 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0237  putative RNA methylase  28.4 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.601089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.5 
 
 		 204 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>