141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1919 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  500  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  43.33 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.25 
 
 		 851 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.25 
 
 		 851 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  36.25 
 
 		 851 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.25 
 
 		 851 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.25 
 
 		 851 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.54 
 
 		 853 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.12 
 
 		 853 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.17 
 
 		 853 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 		 750 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  42.69 
 
 		 255 aa  114  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  33.47 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  35.75 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  31.8 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  33.16 
 
 		 265 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  28.5 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  33.7 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 710 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 711 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0045  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  34.02 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  38.1 
 
 		 868 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0301  hypothetical protein  29.1 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  32.82 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  51.16 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0255  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0321  hypothetical protein  28.03 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  28.4 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0275  hypothetical protein  28.36 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  48.84 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0261  hypothetical protein  28.36 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.47 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  29.27 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  31.31 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  46.51 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  28.09 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  38.46 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  47.62 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.03 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  26.36 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  31.46 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 527 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2181  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 527 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>