34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2737 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  32.99 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  31.69 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  26.95 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3947  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  26.98 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1031  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 224 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  27.78 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  28.05 
 
 		 542 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  37.74 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3493  hypothetical protein  22.94 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.3705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1454 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1451 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  35.44 
 
 		 172 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  38.46 
 
 		 241 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 1739 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  29.09 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  40.35 
 
 		 535 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  28.93 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  28.93 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  24.72 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 196 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>