37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1148 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  78.99 
 
 		 336 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  40.85 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  29.95 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  38.1 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  24.3 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  32.37 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  32.37 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  31.06 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  35.04 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  35.34 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  31.08 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  37.1 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  33.06 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  32.31 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  23.03 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  38.89 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  28.15 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  30 
 
 		 886 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  27.78 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 1152 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  31.52 
 
 		 942 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  17.87 
 
 		 746 aa  46.2  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 		 957 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  45.95 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 1239 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  31.94 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1739 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 214 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.91 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>