24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5405 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  90.03 
 
 		 303 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  90.03 
 
 		 303 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  39.33 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  34.36 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  32.61 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  33.21 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 542 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  31.54 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  30.92 
 
 		 886 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  29.05 
 
 		 336 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  28.51 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 470 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  31.28 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  28.63 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  29.17 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  30.51 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  28.99 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  30.92 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  28.48 
 
 		 194 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  23.92 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  29.09 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>