25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3339 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  700    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  35.4 
 
 
275 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  35.98 
 
 
470 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  31.34 
 
 
542 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  32.61 
 
 
303 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  32.62 
 
 
303 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  32.26 
 
 
303 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  32.33 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  27.5 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  31.97 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  31.08 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  26.09 
 
 
886 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  27.43 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  26.69 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  27.93 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  28.41 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  28.33 
 
 
302 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  26.76 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  30.37 
 
 
267 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  28 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  38.16 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
269 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  26.47 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.91 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
274 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>