27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3792 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  563  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  35.4 
 
 
341 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  34.36 
 
 
470 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  37.28 
 
 
542 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  31.4 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  24.3 
 
 
357 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  32.7 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  30.81 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  22.5 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  32.41 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  30.51 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  29.11 
 
 
886 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  24.58 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  29.19 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  28.24 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  37.66 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  36.78 
 
 
284 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  41.51 
 
 
267 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  25.86 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  34.18 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  38.78 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  48.57 
 
 
345 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  26.44 
 
 
746 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4333  hypothetical protein  45.61 
 
 
353 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 
310 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>