31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4010 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  100 
 
 		 886 aa  1761    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  44.63 
 
 		 306 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  49.83 
 
 		 296 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  50.83 
 
 		 241 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4013  hypothetical protein  48.43 
 
 		 297 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  34.57 
 
 		 296 aa  144  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0206  hypothetical protein  35.97 
 
 		 441 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0123  hypothetical protein  34.85 
 
 		 441 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0181  hypothetical protein  34.85 
 
 		 441 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  105  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  32.57 
 
 		 303 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 470 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  32.96 
 
 		 303 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  32.96 
 
 		 303 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  29.87 
 
 		 542 aa  95.9  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  91.3  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3768  hypothetical protein  31.33 
 
 		 267 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  29.69 
 
 		 297 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  27.95 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  26.09 
 
 		 341 aa  70.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  28.27 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  29.17 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  30 
 
 		 357 aa  56.2  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33128  predicted protein  31.4 
 
 		 318 aa  52.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0835222  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49082  predicted protein  24.3 
 
 		 351 aa  52.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43818  predicted protein  26.32 
 
 		 330 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0305685  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 284 aa  49.3  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  34.29 
 
 		 262 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  38.6 
 
 		 194 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 269 aa  45.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45342  predicted protein  27.17 
 
 		 1366 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>