38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3349 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  76.19 
 
 		 357 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  29.05 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  35.46 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  27.49 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  27.09 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  26.83 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  31.97 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  25.52 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  22.5 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  34.75 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  32.85 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  33.88 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  29.45 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 470 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  35.48 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  41.18 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  28.14 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  29.17 
 
 		 886 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  27.94 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  26.98 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  39.06 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 		 241 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 1152 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3018  hypothetical protein  27.97 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.43 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  34.72 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1007  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.4 
 
 		 249 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1838  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 222 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 1739 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2171  hypothetical protein  41.82 
 
 		 711 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.201556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3493  hypothetical protein  31.67 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.3705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>