24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5350 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  99.01 
 
 		 303 aa  597  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  89.77 
 
 		 303 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  39.08 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  34.08 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  32.26 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  32.26 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  31.92 
 
 		 542 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  32.16 
 
 		 886 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  27.49 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 470 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  27.2 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  30.29 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  29.41 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  30.5 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  29.86 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  28.74 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  27.8 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  26.01 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  30.51 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  28.93 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>