64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3663 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  545  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  32.64 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  32.99 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  31.06 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  37.3 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  25.52 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  30.92 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  28.87 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  28.87 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  31.97 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  30.08 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 1739 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  30.08 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  27.44 
 
 		 306 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  30.72 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  34.18 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3493  hypothetical protein  27.86 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.3705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1454 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1451 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  26.47 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  34.29 
 
 		 886 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3947  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 353 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  37.29 
 
 		 353 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  45.24 
 
 		 868 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  32.5 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 810 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 470 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  30.11 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  30.51 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.39 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.45 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 196 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.46 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  35.71 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  34.88 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.55 
 
 		 345 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 201 aa  42  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>