23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1368 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  79.8 
 
 
297 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  33.97 
 
 
302 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  32.94 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  33.21 
 
 
303 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  30.94 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  28.15 
 
 
542 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  32.7 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
470 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  28.12 
 
 
886 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  29.45 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  32.31 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  27.49 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  28.33 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  28.02 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  23.75 
 
 
306 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  24.79 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  30.08 
 
 
262 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  29.11 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  27.67 
 
 
194 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  28.37 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>