24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1374 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  79.8 
 
 		 302 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  31.92 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  32.26 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  31.85 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  31.54 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  30.36 
 
 		 886 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  30.17 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  31.4 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 542 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  33.88 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  26.59 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  33.06 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  27.93 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  24.4 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  30.08 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  31.88 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  30.25 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  34.38 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  24.72 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>