More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1531 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  82.53 
 
 		 398 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  83.04 
 
 		 398 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  100 
 
 		 397 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  79.7 
 
 		 402 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  82.78 
 
 		 398 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  96.73 
 
 		 397 aa  792    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  80.51 
 
 		 398 aa  660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  82.16 
 
 		 399 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  87.91 
 
 		 399 aa  733    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  82.53 
 
 		 398 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  79.95 
 
 		 402 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  63.04 
 
 		 400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  63.13 
 
 		 407 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  60.8 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  59.75 
 
 		 401 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  61.27 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  58.63 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  60.51 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  57.47 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  55.7 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  57.75 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  57.51 
 
 		 396 aa  455  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  58.25 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  58.25 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  55.39 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  55.81 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  58.04 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  53.41 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  56.61 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  56.28 
 
 		 417 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  54.29 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  55.06 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  55.53 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  57.61 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  55.53 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  55.7 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  55.25 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  55.5 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  54.73 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  57 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  56.75 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  54.73 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  54.09 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  51.45 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  54.73 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  55.14 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  54.23 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  51.71 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  53.48 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  53.98 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  53.98 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  53.48 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  52.76 
 
 		 420 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  51.4 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  53.87 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  52.91 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  55.28 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  53.93 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  53.81 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  53.81 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  53.81 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  53.81 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  53.56 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  53.56 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  51.39 
 
 		 401 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  51.39 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  44.92 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  44.68 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  44.16 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  43.38 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  43.38 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  41.21 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  42.89 
 
 		 460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  40.67 
 
 		 378 aa  279  5e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  41.49 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  42.01 
 
 		 423 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  43.2 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  0.0000032787 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  42.78 
 
 		 423 aa  272  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  43.3 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  43.3 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  40.46 
 
 		 397 aa  266  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  42.53 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  40.53 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  41.24 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  37.94 
 
 		 416 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  30.3 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  34.97 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.51 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  34.42 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  34.15 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33.88 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.74 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.46 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.61 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  30.14 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.54 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.39 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.72 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.81 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>