More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4318 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  587  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  97.34 
 
 
301 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  71.73 
 
 
301 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  49.32 
 
 
308 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.38 
 
 
320 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  50 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  46.37 
 
 
296 aa  261  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.52 
 
 
301 aa  235  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.56 
 
 
330 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.49 
 
 
303 aa  219  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  43.48 
 
 
330 aa  205  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.07 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.91 
 
 
355 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  42.29 
 
 
317 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  44.12 
 
 
322 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  32.7 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
305 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.37 
 
 
304 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
299 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
283 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
305 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
305 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  32.91 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 
306 aa  89  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  26.57 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.61 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  28.26 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  26.16 
 
 
307 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.87 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.04 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  31.52 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  29.03 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30.33 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  29 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.99 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.53 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.02 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  27.37 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.56 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  25.63 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  26.67 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.6 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.82 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  32.63 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  28.67 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  28.46 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  25.99 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  28.89 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.11 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  29.64 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  26.28 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  28.25 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  28.34 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  31.36 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.78 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.77 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  25.8 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  29.53 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.44 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  29.53 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  30.11 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.93 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  25.18 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  23.91 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.13 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.27 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  25.32 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.4 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  27.69 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  23.43 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.68 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  32.32 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  29.07 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  27.56 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.26 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.08 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.79 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.79 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.45 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  33.58 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.55 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.55 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>