104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3235 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  40.19 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  41.12 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  37.14 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  40.95 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  36.19 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  36.19 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  36.19 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  32.38 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  36.79 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  31.9 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  35.54 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  32.71 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.79 
 
 		 650 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  28.16 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.07 
 
 		 478 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  33.02 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 211 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  30.77 
 
 		 170 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  31.4 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  28.33 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  29.31 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  27.88 
 
 		 605 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.96 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  31.13 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  29.52 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  27.36 
 
 		 586 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  31.07 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  27.18 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  31.36 
 
 		 637 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 639 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  29.52 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.26 
 
 		 649 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  29.81 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  30.97 
 
 		 629 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.07 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.87 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  31.87 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 207 aa  42.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  27.36 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  30.53 
 
 		 625 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.55 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  24.81 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  31.31 
 
 		 633 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  25.21 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  25.25 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 485 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1742  cyclic nucleotide-binding protein  32.99 
 
 		 626 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.550637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  27.62 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  32.38 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 141 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.88 
 
 		 606 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  25.77 
 
 		 148 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  27.88 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 649 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  29.17 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  28.16 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  28.16 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  25.62 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  41.27 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.26 
 
 		 660 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  31.82 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>