223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1742 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1742  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 626 aa  1261    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.550637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2465  cyclic nucleotide-binding protein  40.16 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2510  cyclic nucleotide-binding protein  40.16 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2502  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3086  cyclic nucleotide-binding protein  38.89 
 
 		 615 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.238532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2165  hypothetical protein  38.99 
 
 		 490 aa  299  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199835  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1589  putative signal transduction protein with CBS domains  34.87 
 
 		 626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0430994  normal  0.447949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26.42 
 
 		 645 aa  183  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.23 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  25.81 
 
 		 625 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.44 
 
 		 644 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.59 
 
 		 648 aa  173  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.66 
 
 		 660 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  25.73 
 
 		 601 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 		 623 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  24.92 
 
 		 663 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  24.13 
 
 		 646 aa  165  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.08 
 
 		 618 aa  164  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  26.75 
 
 		 606 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  26.88 
 
 		 623 aa  160  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  26.59 
 
 		 606 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.61 
 
 		 649 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  26.48 
 
 		 624 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  24.84 
 
 		 644 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  26.69 
 
 		 606 aa  158  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  24.92 
 
 		 622 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  22.45 
 
 		 638 aa  156  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  25.16 
 
 		 629 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.77 
 
 		 649 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  26.66 
 
 		 603 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 		 606 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.66 
 
 		 601 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.66 
 
 		 601 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  24.88 
 
 		 634 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.48 
 
 		 603 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  25.79 
 
 		 646 aa  150  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  26.43 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.9 
 
 		 642 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  25.16 
 
 		 643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.04 
 
 		 650 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  22.89 
 
 		 626 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.04 
 
 		 603 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  24.08 
 
 		 645 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.88 
 
 		 603 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  25.36 
 
 		 615 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  23.56 
 
 		 646 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24 
 
 		 622 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  24.25 
 
 		 645 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  23.83 
 
 		 624 aa  144  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  22.48 
 
 		 626 aa  143  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  24.04 
 
 		 645 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  23.63 
 
 		 645 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  28.24 
 
 		 481 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.73 
 
 		 606 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  23.6 
 
 		 637 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  24.09 
 
 		 641 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  22.61 
 
 		 641 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  26.6 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  22.87 
 
 		 629 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 615 aa  140  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  25.79 
 
 		 618 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.98 
 
 		 636 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 596 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  23.05 
 
 		 625 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  22.99 
 
 		 637 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  23.14 
 
 		 629 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 		 603 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  25.12 
 
 		 639 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  25.78 
 
 		 641 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.27 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  22.43 
 
 		 628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  23.3 
 
 		 629 aa  135  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.07 
 
 		 667 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.85 
 
 		 596 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  22.68 
 
 		 648 aa  134  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 		 601 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.48 
 
 		 615 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  24.04 
 
 		 615 aa  132  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  21.77 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.39 
 
 		 625 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  24.19 
 
 		 574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  23.56 
 
 		 615 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.21 
 
 		 633 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.71 
 
 		 478 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  23.1 
 
 		 629 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  23.84 
 
 		 615 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  23.97 
 
 		 614 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  27.65 
 
 		 615 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  24.01 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.8 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  23.97 
 
 		 613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  23.8 
 
 		 615 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  23.85 
 
 		 615 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  23.85 
 
 		 615 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  23.9 
 
 		 620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  23.9 
 
 		 620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  25.71 
 
 		 603 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  21.02 
 
 		 600 aa  120  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  26.07 
 
 		 605 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>